46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1648 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2223  protein of unknown function DUF1338  99.78 
 
 		 447 aa  921    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01392  hypothetical protein  99.78 
 
 		 447 aa  921    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2028  hypothetical protein  98.88 
 
 		 447 aa  914    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  hitchhiker  0.0000000000691698 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1718  hypothetical protein  87.7 
 
 		 447 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1533  putative cytoplasmic protein  87.02 
 
 		 447 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1742  putative cytoplasmic protein  87.47 
 
 		 447 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1802  hypothetical protein  87.02 
 
 		 447 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.903691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1738  putative cytoplasmic protein  87.47 
 
 		 447 aa  824    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1648  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1751  hypothetical protein  98.88 
 
 		 447 aa  912    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.98401e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2236  hypothetical protein  98.66 
 
 		 447 aa  911    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1602  hypothetical protein  99.11 
 
 		 447 aa  916    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1505  hypothetical protein  98.66 
 
 		 447 aa  911    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01380  hypothetical protein  99.78 
 
 		 447 aa  921    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1965  hypothetical protein  81.66 
 
 		 447 aa  765    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0664  hypothetical protein  65.77 
 
 		 455 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3786  protein of unknown function DUF1338  61.21 
 
 		 470 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4115  protein of unknown function DUF1338  60.54 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1250  hypothetical protein  61.09 
 
 		 487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0349  protein of unknown function DUF1338  59.96 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03979  hypothetical protein  60.59 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.616638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0211  hypothetical protein  58.67 
 
 		 464 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0132563  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3628  hypothetical protein  57.71 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5260  hypothetical protein  58.22 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3516  hypothetical protein  56.6 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5663  hypothetical protein  60.22 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.458256  normal  0.0265006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5170  hypothetical protein  58.89 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1460  hypothetical protein  56.6 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5312  hypothetical protein  58.22 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1889  hypothetical protein  57.27 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.048244  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0850  hypothetical protein  56.15 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.623293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0907  hypothetical protein  56.15 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.327128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3157  hypothetical protein  54.95 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8485  protein of unknown function DUF1338  57.86 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1714  hypothetical protein  55.97 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2046  hypothetical protein  56.44 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3165  hypothetical protein  53.33 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1961  hypothetical protein  53.56 
 
 		 475 aa  461  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.588491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2575  hypothetical protein  53.68 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2663  hypothetical protein  54.95 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.744438  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0894  hypothetical protein  52.74 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00300  conserved hypothetical protein  49.66 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04380  hypothetical protein  39.69 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.149311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4798  hypothetical protein  37.81 
 
 		 406 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0662939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13321  hypothetical protein  38.89 
 
 		 415 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1644  hypothetical protein  37.61 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.589728  normal  0.39412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>