46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00300 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00300  conserved hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  939    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0850  hypothetical protein  50.98 
 
 
488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.623293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0907  hypothetical protein  51.2 
 
 
466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.327128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1460  hypothetical protein  50.98 
 
 
488 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3516  hypothetical protein  49.23 
 
 
463 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3628  hypothetical protein  50.66 
 
 
482 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3157  hypothetical protein  49.03 
 
 
472 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1889  hypothetical protein  48.79 
 
 
461 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.048244  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0894  hypothetical protein  48.9 
 
 
465 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03979  hypothetical protein  49.45 
 
 
455 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.616638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1250  hypothetical protein  50.89 
 
 
487 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3165  hypothetical protein  48.56 
 
 
468 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0211  hypothetical protein  49.24 
 
 
464 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0132563  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0349  protein of unknown function DUF1338  49.89 
 
 
454 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5260  hypothetical protein  48.68 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.132132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5170  hypothetical protein  48.68 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5312  hypothetical protein  48.89 
 
 
464 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2046  hypothetical protein  48.79 
 
 
458 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0664  hypothetical protein  50 
 
 
455 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3786  protein of unknown function DUF1338  49.12 
 
 
470 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1714  hypothetical protein  48.69 
 
 
468 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8485  protein of unknown function DUF1338  51.94 
 
 
464 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4115  protein of unknown function DUF1338  50.34 
 
 
470 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5663  hypothetical protein  47.69 
 
 
471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.458256  normal  0.0265006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1648  hypothetical protein  49.66 
 
 
447 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2223  protein of unknown function DUF1338  49.89 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01392  hypothetical protein  49.89 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01380  hypothetical protein  49.89 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1602  hypothetical protein  49.66 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2663  hypothetical protein  45.47 
 
 
469 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.744438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2028  hypothetical protein  49.21 
 
 
447 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  hitchhiker  0.0000000000691698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1533  putative cytoplasmic protein  48.99 
 
 
447 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1742  putative cytoplasmic protein  48.99 
 
 
447 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1802  hypothetical protein  48.99 
 
 
447 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.903691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1738  putative cytoplasmic protein  48.99 
 
 
447 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1505  hypothetical protein  49.44 
 
 
447 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1751  hypothetical protein  49.21 
 
 
447 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98401e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2236  hypothetical protein  49.44 
 
 
447 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1718  hypothetical protein  48.76 
 
 
447 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1961  hypothetical protein  45.11 
 
 
475 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.588491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2575  hypothetical protein  44.4 
 
 
478 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1965  hypothetical protein  48.32 
 
 
447 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04380  hypothetical protein  39.31 
 
 
459 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.149311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4798  hypothetical protein  40.9 
 
 
406 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0662939  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13321  hypothetical protein  40.89 
 
 
415 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1644  hypothetical protein  40.18 
 
 
408 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.589728  normal  0.39412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>