81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5308 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  207  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  55 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  53 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  51.49 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  50.5 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  48.51 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  51.52 
 
 		 98 aa  93.2  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  49.5 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  48.48 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  48.48 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  48.54 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  47.47 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  49 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  48.51 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  49.51 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  41.41 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  41.41 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  49.49 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  47.06 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  45.79 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  43.48 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  44.55 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  51.9 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  51.9 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  43.52 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  43.52 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  43.52 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  43.4 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  49.49 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  44.86 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  71.11 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  58.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  48.48 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  76.74 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  35.4 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  40.8 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  51.35 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  47.47 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  63.16 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0116  hypothetical protein  36.96 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  55.93 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4114  hypothetical protein  73.91 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  54.05 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  40.57 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  36.94 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  43.53 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  38.18 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  36.63 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  32.38 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  31.78 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  34.62 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1585  hypothetical protein  28 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000438313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  48.78 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  34.34 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  46.34 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  46.67 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  35.35 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  32.73 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  54.55 
 
 		 362 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  52.5 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  38.64 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  40.48 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  45.24 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  37.21 
 
 		 360 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3426  hypothetical protein  41.3 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  35.35 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  43.9 
 
 		 89 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  37.21 
 
 		 360 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  38.1 
 
 		 360 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  40.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>