76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2058 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  47.42 
 
 		 97 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  47.42 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  54.93 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  45.36 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  49.43 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  42.42 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  41.41 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  70 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  44.76 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  43.01 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  42.16 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  45.88 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  70.83 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  48.81 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  53.97 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  53.97 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  47.19 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  47.19 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  53.97 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  44.34 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  42.57 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  45.74 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  52.11 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  43.52 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  64 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  53.03 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  43.52 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  43.52 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  49.43 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  59.26 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  44.68 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  43.96 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0116  hypothetical protein  62.5 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  44.95 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  68.18 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  61.54 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  69.77 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  56.14 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4114  hypothetical protein  63.04 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  35 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  44.26 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  43.08 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1585  hypothetical protein  37.97 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000438313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  53.85 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  34.34 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  32.56 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  51.22 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  26.92 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  45.28 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  45.28 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  41.3 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  42.22 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  46.67 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  37.31 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  46.67 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  42.22 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  62.5 
 
 		 362 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  39.58 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2256  hypothetical protein  37.97 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.225445  normal  0.0487105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  38.1 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  39.02 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  34.88 
 
 		 360 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  42.5 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  34.88 
 
 		 360 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>