85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0263 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  54.55 
 
 
97 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  59.34 
 
 
92 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  56.52 
 
 
98 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  57.29 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  56.32 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  53.26 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  55.17 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  55.17 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  52.87 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  56.25 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  51.58 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  52.22 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  52.04 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  48.48 
 
 
100 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  54.65 
 
 
80 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  48.48 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  50.53 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  49 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  56.98 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  65.08 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  69.09 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  47.66 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  49.49 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  53.75 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  46.6 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  47.47 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  51.89 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  47.47 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  43.96 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  43.96 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  38.71 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4114  hypothetical protein  75 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  66 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0116  hypothetical protein  68.18 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271016  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  43.16 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  69.39 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  44.76 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  62 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  61.7 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  61.7 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  37.86 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  55.56 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  40.4 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  30.48 
 
 
104 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  39.6 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  29.92 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  34.78 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  42.31 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  45.65 
 
 
123 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  38.71 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  37.23 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  47.83 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  36.05 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  55.26 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  38.3 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  55.26 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  46.51 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  43.9 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  28.89 
 
 
115 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_002936  DET1585  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  42.5 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2256  hypothetical protein  31.03 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.225445  normal  0.0487105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  34.29 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  58.33 
 
 
362 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  44.19 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  42.5 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  36.17 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  36.17 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  40.48 
 
 
364 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6779  hypothetical protein  55.56 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.949511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  35.9 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  35.9 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  43.59 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4967  hypothetical protein  41.03 
 
 
84 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.760569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>