35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6779 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6779  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  275  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.949511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  34.97 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  33.11 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  56.41 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  58.97 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  61.76 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  31.65 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  42.03 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  51.28 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  55.88 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4967  hypothetical protein  52.94 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5083  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4995  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  39.71 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  40.68 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5376  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  47.37 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  51.43 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  52.94 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  52.94 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  48.65 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  43.24 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  29.93 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  27.46 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  51.43 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  54.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  46.88 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  45.71 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  34.38 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  53.85 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  34.38 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>