58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4967 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4967  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  177  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  54.02 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  68.12 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  56.18 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  56.7 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5376  hypothetical protein  68.75 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5083  hypothetical protein  68.75 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4995  hypothetical protein  68.75 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  55.36 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  60.87 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  56.6 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  49.23 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  63.04 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  55.56 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  58.7 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  56.52 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  55.56 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  34.57 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  31.91 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  58.33 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.949511  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  35.06 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  30.26 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  32.84 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  33.78 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  48.72 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  36.9 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  35.14 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  46 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4340  hypothetical protein  38.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180784  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  36.14 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  46 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  46 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  37.66 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  36.17 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  42.5 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  42.5 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  42.5 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  29.67 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  39.13 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  43.59 
 
 		 105 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  43.14 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  32.56 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  37.25 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  40.91 
 
 		 360 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  37.25 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  32.91 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  31.75 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2275  hypothetical protein  46.34 
 
 		 234 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>