69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1913 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  69.23 
 
 
91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4967  hypothetical protein  65.17 
 
 
84 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  53 
 
 
97 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  51.72 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  57.78 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5376  hypothetical protein  66.67 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623079  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5083  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4995  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  58.93 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  55.38 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  53.73 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  63.04 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  65.22 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  59.62 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  60.87 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  60.87 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  48.33 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  66.67 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  38.64 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  37.63 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6779  hypothetical protein  55.81 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.949511  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  36 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  34.02 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  35.29 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  33.68 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  35.56 
 
 
92 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  32 
 
 
105 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  32.29 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  51.06 
 
 
111 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  51.06 
 
 
111 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  32.56 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  51.06 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  35.06 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  32.56 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  34.48 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  32.94 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  32.65 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4340  hypothetical protein  48.94 
 
 
113 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180784  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  44.19 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  31.52 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  45 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  38 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  47.5 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  28.72 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  33 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  43.14 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  33.67 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  31.03 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  27.38 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  43.9 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  31.63 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  27.38 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  47.5 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  30.85 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  44.44 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  47.22 
 
 
360 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  34.48 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  32.05 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  28.92 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  37.04 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  47.22 
 
 
360 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3008  hypothetical protein  51.22 
 
 
241 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000315726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  28.28 
 
 
99 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0936511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>