84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1937 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  61.32 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  60.75 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  51.82 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  65.42 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  50.94 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  48.11 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  49.53 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  56.25 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  48.6 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  49.07 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  49.06 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  55.66 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  53.7 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  48.11 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  48.11 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  44.64 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  46.73 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  51.35 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  49.06 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  42.99 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  42.99 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  41.82 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  43.12 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  47.17 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  47.17 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  64.91 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  40.74 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  46.23 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  74 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  43.4 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  50.62 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  41.13 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  70 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  70 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  67.92 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  72 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4114  hypothetical protein  75.56 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0116  hypothetical protein  39.72 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  38.89 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  34.86 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  36.7 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  34.55 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  35.04 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  34.91 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  45.16 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1585  hypothetical protein  47.17 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  52.38 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  45.65 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  52.38 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  48.08 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  35.85 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  41.18 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  41.3 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  42.11 
 
 		 360 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  54.84 
 
 		 362 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  48.65 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  56.41 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  56.41 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  37.21 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  46.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  37.21 
 
 		 360 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  56.25 
 
 		 470 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03380  cell wall surface anchor protein, putative  54.29 
 
 		 1039 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.644715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  45.24 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5376  hypothetical protein  40.48 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4995  hypothetical protein  40.48 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5083  hypothetical protein  40.48 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5623  hypothetical protein  48.89 
 
 		 778 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00516948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>