55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5622 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  239  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5083  hypothetical protein  71.2 
 
 
129 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4995  hypothetical protein  71.2 
 
 
129 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5376  hypothetical protein  73.68 
 
 
114 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623079  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  51.11 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4967  hypothetical protein  54.02 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  49.41 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  58.82 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  60.87 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  54.72 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  55.32 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  50.72 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  53.33 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  34 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  56.82 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  47.83 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  36.17 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  31.37 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  34.04 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  58.33 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  31.25 
 
 
105 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  34 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6779  hypothetical protein  42.03 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.949511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  32.56 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  32.56 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  51.28 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  34.12 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  31.63 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  34.34 
 
 
99 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  30 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  28.89 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  30 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  32.58 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  31.33 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  45.83 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  45.83 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  45.83 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  39.02 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  33.68 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  28.75 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  31.11 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  28.57 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  33.93 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  41.46 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  31.08 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  31.46 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4340  hypothetical protein  42.22 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180784  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  33.78 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  38.3 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>