54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2846 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  204  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  55 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  51.61 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6779  hypothetical protein  36.62 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.949511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  55.1 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  39.81 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  35.92 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  51.85 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  66.67 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  56.86 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  37.25 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  63.16 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4995  hypothetical protein  58.33 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5083  hypothetical protein  58.33 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5376  hypothetical protein  58.33 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  39 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  58.33 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  62.86 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  61.11 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  37.76 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  36.79 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  35.35 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4967  hypothetical protein  42.19 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  64.71 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  33.98 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  31.37 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  30.39 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  31.13 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  35.35 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  32.08 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  37.27 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  31.31 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  29.29 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  29.29 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  29.29 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  38.38 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  32.32 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  30.1 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  38.03 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  59.26 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  32.32 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  32.35 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  32 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  34 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  29.29 
 
 		 86 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  59.26 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  29 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>