84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6467 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  250  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  70.69 
 
 
123 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  69.39 
 
 
135 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  73.47 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  46.21 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  62.07 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4450  hypothetical protein  61.67 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.764771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  39.34 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  35.54 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5622  hypothetical protein  49.12 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.876821  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  39.02 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4967  hypothetical protein  44.71 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1725  hypothetical protein  43.96 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  34.71 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  34.15 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3217  hypothetical protein  56.86 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843034  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6625  hypothetical protein  47 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4995  hypothetical protein  52.17 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5083  hypothetical protein  52.17 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02460  hypothetical protein  54.35 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.583126  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  36.89 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5376  hypothetical protein  52.17 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623079  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  34.43 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  33.61 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  33.06 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1913  hypothetical protein  37.4 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  42.86 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2846  hypothetical protein  39.17 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  35.25 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  36.59 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  33.87 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  30.33 
 
 
85 aa  57  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  33.07 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  34.43 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  34.43 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  45.45 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  39.39 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  29.75 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  29.75 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  58.97 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  33.61 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  33.61 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  33.61 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  46.94 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  56.41 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  56.41 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  48.78 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  33.61 
 
 
97 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  31.97 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  40.54 
 
 
105 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  28.69 
 
 
99 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  42.86 
 
 
113 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  28.46 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4114  hypothetical protein  51.22 
 
 
126 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4340  hypothetical protein  53.85 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180784  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  34.13 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  31.97 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  45 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  50 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0116  hypothetical protein  32.14 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271016  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  34.4 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  27.87 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  39.34 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  47.62 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  34.15 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  41.82 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  47.62 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6779  hypothetical protein  45.24 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.949511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  43.9 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  36.07 
 
 
81 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  36.07 
 
 
81 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3008  hypothetical protein  46.94 
 
 
241 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000315726  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  46.34 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  46.34 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  46.34 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  46.15 
 
 
360 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  46.15 
 
 
360 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2275  hypothetical protein  39.13 
 
 
234 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  38.46 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  38.46 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>