40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3604 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  292  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  292  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3171  hypothetical protein  51.16 
 
 
132 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01743  hypothetical protein  34.95 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  29.17 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1585  hypothetical protein  28.33 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000438313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  29.17 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1795  hypothetical protein  27.91 
 
 
239 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.381855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3426  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0392  hypothetical protein  27.88 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0390  hypothetical protein  27.88 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0362  hypothetical protein  27.88 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  30.97 
 
 
360 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  27.62 
 
 
360 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  27.62 
 
 
360 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4700  hypothetical protein  27.2 
 
 
288 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  24.82 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  29.36 
 
 
360 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4217  hypothetical protein  24.04 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5063  hypothetical protein  45.24 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4551  hypothetical protein  45.24 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.803955  normal  0.544019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  43.18 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1847  hypothetical protein  26.67 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000442538  normal  0.734026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  41.03 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1166  hypothetical protein  42.5 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.939794  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  25.71 
 
 
362 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  38.1 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  40.48 
 
 
101 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  45 
 
 
101 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  39.02 
 
 
111 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  39.02 
 
 
111 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  32.2 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2275  hypothetical protein  28.79 
 
 
234 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3949  hypothetical protein  41.46 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  36.17 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1073  hypothetical protein  27.68 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5184  hypothetical protein  27.03 
 
 
245 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2180  hypothetical protein  43.59 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  42.11 
 
 
89 aa  40  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6467  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  40  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>