33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3426 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  50.37 
 
 		 201 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  27.5 
 
 		 362 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 360 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 360 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  31.25 
 
 		 360 aa  48.5  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1073  hypothetical protein  29.58 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  42.37 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  40.68 
 
 		 111 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  40.68 
 
 		 111 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3171  hypothetical protein  23.08 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4340  hypothetical protein  38.98 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180784  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  45.65 
 
 		 89 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  44.7  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01743  hypothetical protein  22.73 
 
 		 123 aa  44.7  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3008  hypothetical protein  31.4 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000315726  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  29.73 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  29.46 
 
 		 364 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  41.3 
 
 		 95 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  43.48 
 
 		 95 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  29.09 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  36.92 
 
 		 85 aa  42.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  31.51 
 
 		 360 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  46.34 
 
 		 75 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  41.3 
 
 		 99 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  46.34 
 
 		 89 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1847  hypothetical protein  43.18 
 
 		 108 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000442538  normal  0.734026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  40.91 
 
 		 106 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  31.65 
 
 		 107 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>