28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3171 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3171  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  51.16 
 
 
140 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  51.16 
 
 
140 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01743  hypothetical protein  40.38 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1795  hypothetical protein  27.07 
 
 
239 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.381855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2517  hypothetical protein  29.6 
 
 
248 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2275  hypothetical protein  32.14 
 
 
234 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1585  hypothetical protein  27.78 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  26.36 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  29.81 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3008  hypothetical protein  32.76 
 
 
241 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000315726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5184  hypothetical protein  28.3 
 
 
245 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0362  hypothetical protein  24.75 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0390  hypothetical protein  24.75 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0392  hypothetical protein  24.75 
 
 
127 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0773  hypothetical protein  27.42 
 
 
196 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3426  hypothetical protein  23.08 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0067  hypothetical protein  25.45 
 
 
243 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0047  hypothetical protein  25.45 
 
 
246 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.729791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  31.36 
 
 
360 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0101  hypothetical protein  25.89 
 
 
241 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  25.22 
 
 
201 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4217  hypothetical protein  22.77 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  27.19 
 
 
362 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4700  hypothetical protein  23.78 
 
 
288 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1165  hypothetical protein  26.37 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.920968  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  28.43 
 
 
360 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  28.43 
 
 
360 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>