79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1469 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1585  hypothetical protein  91.34 
 
 		 127 aa  237  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000438313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  85.83 
 
 		 127 aa  229  9e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  42.42 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  41.51 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  34 
 
 		 360 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  30.86 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  30.86 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  40.58 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  37.68 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  37.68 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  37.68 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  40.58 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  40.58 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  40.58 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  40.58 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  32.08 
 
 		 360 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  53.49 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  36.23 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  42 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  40.32 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 360 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  45.45 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  48.89 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  34.18 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  31.17 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  39.22 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2517  hypothetical protein  26.09 
 
 		 248 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  53.66 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  45.83 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  31.65 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3008  hypothetical protein  27.12 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000315726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  32.88 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3171  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2275  hypothetical protein  26.89 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5184  hypothetical protein  25.86 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  51.22 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  43.9 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  42.22 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  31.03 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  51.22 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  51.22 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0773  hypothetical protein  24.32 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  42.5 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  42.31 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4217  hypothetical protein  24.41 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  37.04 
 
 		 101 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  45.28 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  51.22 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  43.9 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4700  hypothetical protein  29.73 
 
 		 288 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  41.86 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4114  hypothetical protein  46.34 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  26.85 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  48.78 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  54.05 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01743  hypothetical protein  27.52 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0390  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0392  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3667  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16173  hitchhiker  0.0000117382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0116  hypothetical protein  41.86 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  31.82 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0362  hypothetical protein  27 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  36.51 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  38.1 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  34.92 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  32.31 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  31.43 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000442538  normal  0.734026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>