14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1847 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1847  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000442538  normal  0.734026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1035  hypothetical protein  71.13 
 
 		 98 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4322  hypothetical protein  29.29 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4344  hypothetical protein  29.29 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4190  hypothetical protein  28.28 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00787541  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4340  hypothetical protein  29.29 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180784  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  43.5  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2256  hypothetical protein  36.67 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.225445  normal  0.0487105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3426  hypothetical protein  43.18 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  41.3 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>