53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3781 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3426  hypothetical protein  50.37 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5308  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.643956  normal  0.0553177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1727  hypothetical protein  55.81 
 
 		 89 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.303843 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  51.16 
 
 		 85 aa  48.5  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  46.51 
 
 		 99 aa  48.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  46.51 
 
 		 95 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  48.78 
 
 		 89 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  48.78 
 
 		 75 aa  46.6  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2517  hypothetical protein  27.97 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3604  hypothetical protein  24.82 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3108  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.468234  normal  0.932148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2502  hypothetical protein  24.82 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  51.11 
 
 		 95 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  48.89 
 
 		 97 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  39.39 
 
 		 101 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0810  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0900  hypothetical protein  46.51 
 
 		 104 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  46.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  41.86 
 
 		 99 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  34.02 
 
 		 92 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  46.34 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  46.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  31.58 
 
 		 86 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  46.51 
 
 		 86 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  46.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  41.86 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3171  hypothetical protein  25.22 
 
 		 132 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2278  hypothetical protein  41.86 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0276455 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  52.38 
 
 		 79 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1568  hypothetical protein  51.16 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.714703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  41.18 
 
 		 98 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  44.19 
 
 		 100 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  46.67 
 
 		 104 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  44.19 
 
 		 100 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  44.19 
 
 		 100 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2256  hypothetical protein  57.69 
 
 		 82 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.225445  normal  0.0487105 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1469  hypothetical protein  32.31 
 
 		 126 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0773  hypothetical protein  27.91 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1937  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  41.6  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0979106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  44.19 
 
 		 88 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000180232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  34.29 
 
 		 107 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>