51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2256 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2256  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  166  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.225445  normal  0.0487105 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0522  hypothetical protein  63.08 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.693069  normal  0.291544 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1458  hypothetical protein  63.49 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1144  putative cytoplasmic protein  35.63 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0806  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1879  hypothetical protein  60.61 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0569  hypothetical protein  36.47 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4487  hypothetical protein  32.18 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1136  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.550312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1970  hypothetical protein  36.14 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000806242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2909  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0736581  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2753  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1283  hypothetical protein  37.5 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.51451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1179  hypothetical protein  32.94 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.968454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1298  hypothetical protein  32.94 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4404  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1233  hypothetical protein  35.8 
 
 
100 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1144  hypothetical protein  32.29 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.367251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3513  hypothetical protein  34.02 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191623  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1364  hypothetical protein  30.63 
 
 
105 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0566  hypothetical protein  46.34 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.263576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1288  hypothetical protein  55 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2217  hypothetical protein  36.25 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1152  hypothetical protein  33.73 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1140  hypothetical protein  33.73 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0263  hypothetical protein  31.03 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134746  normal  0.0540828 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0125  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.188144  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1702  hypothetical protein  32.98 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.14705  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1877  hypothetical protein  56.41 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7424  hypothetical protein  48.78 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0936511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3607  hypothetical protein  29.49 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  66.67 
 
 
360 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0057  hypothetical protein  34.18 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2585  hypothetical protein  31.18 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1261  hypothetical protein  69.23 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0285335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1847  hypothetical protein  36.67 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000442538  normal  0.734026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2058  hypothetical protein  37.97 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.890289  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0780  hypothetical protein  69.23 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3781  hypothetical protein  57.69 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  66.67 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1948  hypothetical protein  37.97 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4107  hypothetical protein  39.29 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.616436  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2057  hypothetical protein  65.38 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378088  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5519  hypothetical protein  57.14 
 
 
106 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191566  normal  0.0531985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0116  hypothetical protein  46.34 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271016  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1368  hypothetical protein  29.79 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0478882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1138  hypothetical protein  47.37 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4535  hypothetical protein  64 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0785108  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0313  hypothetical protein  31.87 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0108268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  51.72 
 
 
362 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1197  hypothetical protein  35.62 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.7578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>