More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4868 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4868  esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00085795  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4336  esterase/lipase/thioesterase  68.92 
 
 
324 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2107  hypothetical protein  40.41 
 
 
316 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0848  putative carboxylesterase  41.06 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000392053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4533  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.89 
 
 
294 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768836  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4633  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.9 
 
 
284 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.416952  normal  0.230577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2890  putative lipase/carboxylesterase protein  38.89 
 
 
290 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5138  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.07 
 
 
286 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0512  putative carboxylesterase  44.67 
 
 
294 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1467  putative carboxylesterase  44.16 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1839  lipase-like protein LlpE  44.16 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2143  putative carboxylesterase  43.15 
 
 
284 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0415  putative carboxylesterase  43.15 
 
 
284 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0826  putative carboxylesterase  43.15 
 
 
294 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02619  lipase protein  43.17 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  44.95 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  39.91 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.34 
 
 
363 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.27 
 
 
310 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.27 
 
 
310 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4336  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.34 
 
 
363 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.38701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1791  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.21 
 
 
281 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.87 
 
 
310 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2561  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.23 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.24 
 
 
313 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  33.71 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0870  putative esterase protein  44.1 
 
 
304 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173636  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0294  esterase/lipase/thioesterase  39.39 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2879  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.24 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.571026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4917  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.39 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3013  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.47 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.96 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5353  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.47 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.53 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106948  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3430  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.39 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.63 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38 
 
 
311 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.21 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  38.78 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.93 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.43 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  37 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  33.47 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.11 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  36.99 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.81 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.117524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  32.61 
 
 
337 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.61 
 
 
337 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3372  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.84 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0064  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.3 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295907  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.29 
 
 
337 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.88 
 
 
317 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.3 
 
 
312 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1361  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.66 
 
 
281 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.12 
 
 
313 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.09 
 
 
337 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1296  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 
303 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37 
 
 
306 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.23 
 
 
350 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.77 
 
 
382 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.4 
 
 
328 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.86 
 
 
332 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.89 
 
 
314 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.63 
 
 
344 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  33.06 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  34.63 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.75 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.96 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.23 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36 
 
 
311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.09 
 
 
312 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  36.06 
 
 
365 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.48 
 
 
342 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  34.65 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.82 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5770  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.2 
 
 
344 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.950469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.85 
 
 
320 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6135  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.2 
 
 
344 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  normal  0.96238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.41 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  33.04 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  35.21 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.23 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.05 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0321  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.73 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
324 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.28 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.07 
 
 
324 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.3 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.21 
 
 
344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.51 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.47 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  36.45 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.34 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  33.48 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.41 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.94 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0292  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.62 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  34.76 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>