More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4226 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4336  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
363 aa  726    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.38701 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
363 aa  726    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_003296  RS02619  lipase protein  75.45 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0826  putative carboxylesterase  51.53 
 
 
294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0415  putative carboxylesterase  51.53 
 
 
284 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2143  putative carboxylesterase  51.53 
 
 
284 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1467  putative carboxylesterase  51.53 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1839  lipase-like protein LlpE  51.53 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0512  putative carboxylesterase  51.15 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4533  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  47.06 
 
 
294 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768836  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0848  putative carboxylesterase  47.62 
 
 
291 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000392053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2107  hypothetical protein  50.76 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4633  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.64 
 
 
284 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.416952  normal  0.230577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50 
 
 
286 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106948  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  49.64 
 
 
286 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3372  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.21 
 
 
286 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4917  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.39 
 
 
286 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0294  esterase/lipase/thioesterase  49.29 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3013  Alpha/beta hydrolase fold-3  50.39 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5353  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.39 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2890  putative lipase/carboxylesterase protein  47.67 
 
 
290 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1791  Alpha/beta hydrolase fold-3  46.72 
 
 
281 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3830  esterase/lipase/thioesterase  53.49 
 
 
290 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.418878  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4868  esterase/lipase/thioesterase  40.34 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00085795  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.06 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  42.19 
 
 
310 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.19 
 
 
310 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.11 
 
 
337 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.49 
 
 
337 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.02 
 
 
324 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4336  esterase/lipase/thioesterase  41.13 
 
 
324 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  37.88 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.35 
 
 
310 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.47 
 
 
313 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.04 
 
 
313 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  38.75 
 
 
311 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.51 
 
 
307 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  38.79 
 
 
309 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.12 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  39.66 
 
 
444 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3430  Alpha/beta hydrolase fold-3  45.81 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.13 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0321  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.76 
 
 
276 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0870  putative esterase protein  45.67 
 
 
304 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173636  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  32.38 
 
 
321 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  36.57 
 
 
312 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  31.97 
 
 
321 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.29 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  36.8 
 
 
310 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.76 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.37 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  38.46 
 
 
311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5138  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.33 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.91 
 
 
326 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  34.31 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  37.4 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.93 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.19 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2561  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.29 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  31.8 
 
 
337 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.8 
 
 
337 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.15 
 
 
338 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.18 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  39.83 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.62 
 
 
309 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.68 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  36.51 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05501  lipase/esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01050)  32.13 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.737319  normal  0.319668 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.44 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.83 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.91 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.34 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.84 
 
 
311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.73 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.99 
 
 
310 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.88 
 
 
309 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.89 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.93 
 
 
628 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.5 
 
 
350 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.89 
 
 
339 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.6 
 
 
318 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4715  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
296 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.93 
 
 
349 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  34.03 
 
 
339 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.95 
 
 
321 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  33.05 
 
 
337 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.01 
 
 
311 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.71 
 
 
323 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.92 
 
 
310 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.47 
 
 
317 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.02 
 
 
311 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.47 
 
 
339 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2196  lipase  33.06 
 
 
341 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.48 
 
 
342 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.72 
 
 
308 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.08 
 
 
308 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.38 
 
 
330 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.78 
 
 
326 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.68 
 
 
300 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>