More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2561 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2561  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5138  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  67.64 
 
 
286 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.41 
 
 
279 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.117524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1361  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  55.89 
 
 
281 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0870  putative esterase protein  52.79 
 
 
304 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173636  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3430  Alpha/beta hydrolase fold-3  53.85 
 
 
297 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1296  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  54.3 
 
 
303 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0321  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.46 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3354  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.77 
 
 
270 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.0196184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3097  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 
271 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.653129  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2879  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.97 
 
 
283 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.571026  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5482  lipase esterase  43.63 
 
 
265 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000559952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0064  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.06 
 
 
270 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295907  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2107  hypothetical protein  42.72 
 
 
316 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4868  esterase/lipase/thioesterase  37.23 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00085795  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4336  esterase/lipase/thioesterase  39.52 
 
 
324 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0826  putative carboxylesterase  40.76 
 
 
294 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1467  putative carboxylesterase  40.76 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1839  lipase-like protein LlpE  40.76 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2143  putative carboxylesterase  40.76 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0415  putative carboxylesterase  40.76 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.77 
 
 
628 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.59 
 
 
313 aa  139  7e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0512  putative carboxylesterase  40.34 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1791  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.43 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3372  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.83 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.38 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2556  carboxylesterase  36.05 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.6 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.08 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  35.62 
 
 
318 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4917  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.08 
 
 
286 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.7 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106948  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3013  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.08 
 
 
313 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5353  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.08 
 
 
313 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  35.81 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.09 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05501  lipase/esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01050)  34.7 
 
 
332 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.737319  normal  0.319668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.07 
 
 
311 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.64 
 
 
292 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.61 
 
 
311 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  35.8 
 
 
312 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.12 
 
 
301 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.05 
 
 
320 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.58 
 
 
310 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.07 
 
 
309 aa  122  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.58 
 
 
310 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0294  esterase/lipase/thioesterase  36.33 
 
 
286 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.51 
 
 
370 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  32.39 
 
 
444 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4533  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.45 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768836  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4633  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.74 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.416952  normal  0.230577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0848  putative carboxylesterase  36.07 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000392053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.91 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.94 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.25 
 
 
313 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.84 
 
 
308 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2890  putative lipase/carboxylesterase protein  38.73 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_003296  RS02619  lipase protein  43.08 
 
 
357 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  32.4 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  38.1 
 
 
320 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.24 
 
 
311 aa  119  7e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  39.44 
 
 
310 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09330  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4226  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.29 
 
 
363 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.975895 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4336  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.29 
 
 
363 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.38701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  35.19 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  32 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.6 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.42 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.44 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.99 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.44 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1004  heroin esterase  37.28 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.64 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.93 
 
 
311 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.95 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  37.61 
 
 
311 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.44 
 
 
337 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  33.8 
 
 
319 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.48 
 
 
314 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.2 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.4 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  32.56 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3830  esterase/lipase/thioesterase  39.82 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.418878  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  38.36 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3668  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.99 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.82 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.2 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.28 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.56 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.04 
 
 
321 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  35.11 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.73 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3254  lipase  33.91 
 
 
316 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0525665  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.76 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0735  esterase  33.19 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.27 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1005  lipase  33.19 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.50865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>