111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2847 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2847  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  236  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000186379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  39.76 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 173 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1793  single-strand DNA binding protein  34.57 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  34.15 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  34.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  34.57 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  34.15 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  34.57 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  30.59 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  30.59 
 
 		 225 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 181 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  32.93 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3622  single-strand binding protein  30.86 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0622849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  35.37 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  34.15 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  28.7 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  34.88 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  34.88 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  32.32 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  28.7 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  34.15 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  32.1 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  30.49 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  29.27 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  32.93 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  32.93 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  34.44 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  33.72 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  33.72 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  33.72 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  33.72 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  33.72 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  32.93 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  30.49 
 
 		 151 aa  42  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  31.76 
 
 		 196 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  37.8 
 
 		 167 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1091  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  31.25 
 
 		 176 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.541442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  30.49 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  30.59 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 236 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 235 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  32.1 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  31.33 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  32.56 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  30 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  30.23 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>