More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2162 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2162  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 576 aa  1193    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1611  ferredoxin  35.22 
 
 		 560 aa  327  5e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.972775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.99 
 
 		 903 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0480  ferredoxin  36.84 
 
 		 628 aa  293  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4517  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  35.1 
 
 		 539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  42.59 
 
 		 689 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.21 
 
 		 913 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1282  ferredoxin  33.75 
 
 		 583 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1383  ferredoxin  34.44 
 
 		 583 aa  253  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0368296  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  40.44 
 
 		 680 aa  251  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2566  ferredoxin  36.42 
 
 		 583 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  36.18 
 
 		 776 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 		 776 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 		 776 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 		 776 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 		 776 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 		 776 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  37.23 
 
 		 776 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  35.65 
 
 		 777 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  36.39 
 
 		 777 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  34.73 
 
 		 776 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  34.51 
 
 		 776 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  35.9 
 
 		 777 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  39.5 
 
 		 694 aa  240  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  37.77 
 
 		 771 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1294  ferredoxin  34.43 
 
 		 603 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  40.39 
 
 		 795 aa  240  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  34.65 
 
 		 776 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  34.65 
 
 		 776 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  37.53 
 
 		 776 aa  239  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  34.65 
 
 		 776 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  39.12 
 
 		 694 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.77 
 
 		 770 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  38.03 
 
 		 784 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  34.65 
 
 		 776 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  38.16 
 
 		 683 aa  238  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  39.5 
 
 		 694 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  39.57 
 
 		 673 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  39.94 
 
 		 686 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.14 
 
 		 923 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  38.02 
 
 		 693 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  37.74 
 
 		 693 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  37.36 
 
 		 679 aa  234  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 		 693 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  35.31 
 
 		 776 aa  234  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  39.06 
 
 		 669 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  39.12 
 
 		 660 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  38.38 
 
 		 779 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  37.6 
 
 		 700 aa  233  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  39.83 
 
 		 689 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  35.31 
 
 		 682 aa  231  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.78 
 
 		 771 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  39.07 
 
 		 797 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  41.44 
 
 		 918 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1277  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.43 
 
 		 791 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  37.81 
 
 		 809 aa  230  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1871  NADH-quinone oxidoreductase chain G  36.31 
 
 		 788 aa  230  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  34.42 
 
 		 783 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  38.66 
 
 		 744 aa  229  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  36.89 
 
 		 783 aa  229  9e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  36.89 
 
 		 783 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  35.35 
 
 		 707 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  39.84 
 
 		 671 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  38.31 
 
 		 791 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  38.63 
 
 		 685 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  34.42 
 
 		 783 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  34.42 
 
 		 783 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  36.86 
 
 		 715 aa  227  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  36.16 
 
 		 693 aa  227  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  36.32 
 
 		 674 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  39.89 
 
 		 654 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  36.86 
 
 		 710 aa  226  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  38.87 
 
 		 739 aa  226  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.72 
 
 		 798 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  38.06 
 
 		 811 aa  226  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.33 
 
 		 823 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3863  ferredoxin  29.95 
 
 		 569 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  36.56 
 
 		 716 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.67 
 
 		 796 aa  226  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  38.15 
 
 		 693 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  36.83 
 
 		 720 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  37.74 
 
 		 689 aa  224  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  38.42 
 
 		 672 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  34.54 
 
 		 791 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  38.63 
 
 		 797 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0915  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.14 
 
 		 721 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  36.96 
 
 		 719 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.87 
 
 		 771 aa  224  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  35.36 
 
 		 808 aa  224  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  34.21 
 
 		 790 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0421  NADH dehydrogenase subunit G  36.21 
 
 		 683 aa  223  6e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  42.01 
 
 		 667 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  36.56 
 
 		 717 aa  223  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  35.95 
 
 		 777 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.89 
 
 		 801 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1361  NADH dehydrogenase subunit G  37.57 
 
 		 699 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587534  normal  0.089712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03220  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 		 829 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0591623  normal  0.693511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  36.87 
 
 		 670 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2710  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.36 
 
 		 884 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2879  NADH dehydrogenase subunit G  33.83 
 
 		 691 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.644938  normal  0.120527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>