More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0480 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0480  ferredoxin  100 
 
 
628 aa  1284    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1611  ferredoxin  40.88 
 
 
560 aa  436  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.972775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2566  ferredoxin  40.38 
 
 
583 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1383  ferredoxin  38.97 
 
 
583 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0368296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1282  ferredoxin  38.12 
 
 
583 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2162  NADH dehydrogenase  37.13 
 
 
576 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  42.7 
 
 
903 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1294  ferredoxin  38.02 
 
 
603 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  45.2 
 
 
913 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4517  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  33.73 
 
 
539 aa  283  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594649  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  44.24 
 
 
918 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2294  NADH dehydrogenase subunit G  41.27 
 
 
669 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  40 
 
 
715 aa  274  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  39.67 
 
 
777 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  43.15 
 
 
685 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  39.45 
 
 
783 aa  273  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3863  ferredoxin  34.17 
 
 
569 aa  273  8.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  40.33 
 
 
783 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 
710 aa  272  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  39.39 
 
 
777 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 
790 aa  273  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  40.33 
 
 
783 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  39.45 
 
 
777 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  39.45 
 
 
791 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  38.36 
 
 
809 aa  270  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  43.94 
 
 
923 aa  270  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 
776 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 
776 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 
776 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 
776 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 
776 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 
776 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  39.56 
 
 
776 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  38.67 
 
 
776 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  38.4 
 
 
776 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  38.4 
 
 
776 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  38.4 
 
 
776 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1561  NADH dehydrogenase subunit G  40.27 
 
 
689 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 
707 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  38.4 
 
 
776 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  38.36 
 
 
777 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  38.9 
 
 
716 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  38.4 
 
 
776 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  38.36 
 
 
719 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  38.12 
 
 
776 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  39.29 
 
 
779 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  39.78 
 
 
797 aa  264  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.81 
 
 
771 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  39.3 
 
 
744 aa  262  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  38.74 
 
 
776 aa  263  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  38.08 
 
 
720 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  38.15 
 
 
771 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.87 
 
 
770 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  38.52 
 
 
784 aa  258  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  37.6 
 
 
717 aa  257  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  38.86 
 
 
739 aa  257  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  40.37 
 
 
744 aa  256  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  40.37 
 
 
744 aa  256  7e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 
673 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.8 
 
 
798 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.76 
 
 
771 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
714 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  37.4 
 
 
808 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.14 
 
 
797 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.94 
 
 
823 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  36.16 
 
 
721 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  32.22 
 
 
660 aa  250  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.93 
 
 
782 aa  250  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  36.93 
 
 
782 aa  250  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2689  NADH dehydrogenase subunit G  41.32 
 
 
827 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  30.4 
 
 
694 aa  249  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  30.65 
 
 
694 aa  249  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0526  NADH dehydrogenase subunit G  37.67 
 
 
811 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4555  NADH dehydrogenase subunit G  32.63 
 
 
689 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  37.06 
 
 
795 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  38.19 
 
 
686 aa  248  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1303  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 
670 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.406307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4487  NADH dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 
799 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.293671  normal  0.0319104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.14 
 
 
796 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0369  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.78 
 
 
833 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.55399  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5059  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.36 
 
 
830 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697317  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  37.2 
 
 
791 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  43.16 
 
 
689 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  41.93 
 
 
680 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07440  NADH dehydrogenase subunit G  31.6 
 
 
879 aa  243  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0653934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0590  molybdopterin oxidoreductase  40.85 
 
 
807 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.726223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2991  NADH dehydrogenase subunit G  42.91 
 
 
667 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0287  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.48 
 
 
801 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  42.11 
 
 
686 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01310  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  39.57 
 
 
775 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754341  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  37.09 
 
 
689 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  37.47 
 
 
693 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  36.99 
 
 
679 aa  241  4e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4412  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.51 
 
 
815 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2580  NADH dehydrogenase subunit G  39.78 
 
 
691 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.105022  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1544  NADH dehydrogenase subunit G  37.29 
 
 
801 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1280  NADH-quinone oxidoreductase chain G  38.08 
 
 
797 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  37.74 
 
 
797 aa  238  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3292  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 
691 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.995096  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  39.13 
 
 
671 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>