More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3863 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3863  ferredoxin  100 
 
 		 569 aa  1172    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2566  ferredoxin  37.42 
 
 		 583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1282  ferredoxin  36.8 
 
 		 583 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1383  ferredoxin  36.8 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0368296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1294  ferredoxin  36.55 
 
 		 603 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1611  ferredoxin  33.51 
 
 		 560 aa  283  7.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.972775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0480  ferredoxin  34.17 
 
 		 628 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4517  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  32.88 
 
 		 539 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  39.48 
 
 		 782 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.48 
 
 		 782 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  39.77 
 
 		 797 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.47 
 
 		 903 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2559  NADH dehydrogenase subunit G  40.06 
 
 		 797 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.437488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1823  NADH dehydrogenase subunit G  42.2 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1441  NADH dehydrogenase subunit G  42.2 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1296  NADH dehydrogenase subunit G  42.2 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1136  NADH dehydrogenase subunit G  42.2 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0419  NADH dehydrogenase subunit G  42.2 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1305  NADH dehydrogenase subunit G  42.2 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0731  NADH dehydrogenase subunit G  42.2 
 
 		 776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1885  NADH dehydrogenase subunit G  39.03 
 
 		 783 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2208  NADH dehydrogenase subunit G  39.03 
 
 		 783 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.336643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1067  NADH dehydrogenase subunit G  43.12 
 
 		 776 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1097  NADH dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 		 809 aa  253  7e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.19 
 
 		 918 aa  253  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2056  NADH dehydrogenase subunit G  39.2 
 
 		 783 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.81056  normal  0.0464837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2160  NADH dehydrogenase subunit G  41.59 
 
 		 776 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.26978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  41.26 
 
 		 776 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2281  NADH dehydrogenase subunit G  41.59 
 
 		 776 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.936523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1359  NADH dehydrogenase subunit G  39.08 
 
 		 693 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1267  NADH dehydrogenase subunit G  39.03 
 
 		 693 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2267  NADH dehydrogenase subunit G  40.85 
 
 		 776 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263925  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.45 
 
 		 923 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0714  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.31 
 
 		 798 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1631  NADH dehydrogenase subunit G  40.85 
 
 		 776 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2243  NADH dehydrogenase subunit G  40.85 
 
 		 776 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5571  NADH dehydrogenase subunit G  40.85 
 
 		 776 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.199302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0992  NADH dehydrogenase subunit G  38.86 
 
 		 791 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.529585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0933  NADH dehydrogenase subunit G  39.88 
 
 		 790 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  39.02 
 
 		 700 aa  247  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1720  NADH dehydrogenase subunit G  39.37 
 
 		 693 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1430  NADH dehydrogenase subunit G  38.51 
 
 		 714 aa  247  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.718625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3250  NADH dehydrogenase subunit G  38.22 
 
 		 717 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0784  NADH dehydrogenase subunit G  40.3 
 
 		 689 aa  246  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00939613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0955  NADH dehydrogenase subunit G  40.98 
 
 		 777 aa  246  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.391451  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2417  NADH dehydrogenase subunit G  38.35 
 
 		 694 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0751  NADH dehydrogenase subunit G  38.62 
 
 		 660 aa  246  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0442747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01293  NADH dehydrogenase subunit G  40.31 
 
 		 739 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0967  NADH dehydrogenase subunit G  39.09 
 
 		 791 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0699273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0896  NADH dehydrogenase subunit G  39.54 
 
 		 693 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2825  NADH dehydrogenase subunit G  40.24 
 
 		 744 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.266066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1748  NADH dehydrogenase subunit G  40.85 
 
 		 779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1409  putative NADH dehydrogenase I chain G  37.64 
 
 		 771 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277288 
 
 
-
 
NC_004310  BR0808  NADH dehydrogenase subunit G  38.07 
 
 		 694 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5174  NADH dehydrogenase subunit G  39.82 
 
 		 707 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1499  NADH dehydrogenase subunit G  39.14 
 
 		 721 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1045  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  40.12 
 
 		 771 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1028  NADH dehydrogenase subunit G  40.53 
 
 		 693 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0803  NADH dehydrogenase subunit G  38.07 
 
 		 694 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.727429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1320  NADH dehydrogenase subunit G  39.71 
 
 		 672 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568369  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2807  NADH dehydrogenase subunit G  39.45 
 
 		 719 aa  243  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434484  normal  0.352791 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0827  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  39.51 
 
 		 771 aa  243  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.342284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.46 
 
 		 797 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1958  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  37.68 
 
 		 796 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.254325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0963  NADH dehydrogenase subunit G  38.79 
 
 		 715 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.409091  normal  0.052717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0927  NADH dehydrogenase subunit G  40.58 
 
 		 686 aa  240  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  36.61 
 
 		 823 aa  240  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2003  NADH dehydrogenase subunit G  37.93 
 
 		 777 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643114  normal  0.247059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1349  NADH dehydrogenase subunit G  39.33 
 
 		 777 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234349  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3504  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 720 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2241  NADH dehydrogenase subunit G  37.86 
 
 		 674 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3208  NADH dehydrogenase subunit G  39.02 
 
 		 777 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0878  NADH dehydrogenase subunit G  38.51 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1759  NADH dehydrogenase subunit G  38.84 
 
 		 795 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1507  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.84 
 
 		 770 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00792374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  37.71 
 
 		 784 aa  236  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0053  NADH dehydrogenase subunit G  37.07 
 
 		 679 aa  236  8e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.292666  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1183  NADH dehydrogenase subunit G  37.75 
 
 		 672 aa  236  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.551845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1182  NADH dehydrogenase subunit G  38.01 
 
 		 673 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.577988  normal  0.579246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  38.04 
 
 		 913 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0160  NADH dehydrogenase subunit G  38.86 
 
 		 682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2055  NADH dehydrogenase subunit G  38.04 
 
 		 808 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1269  NADH dehydrogenase subunit G  37.32 
 
 		 716 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.626778  normal  0.299354 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0162  NADH-quinone oxidoreductase, g subunit  36.28 
 
 		 464 aa  234  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3334  NADH dehydrogenase subunit G  40.51 
 
 		 689 aa  232  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2521  NADH dehydrogenase subunit G  38.32 
 
 		 654 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3220  NADH dehydrogenase subunit G  38.64 
 
 		 680 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0634  ferredoxin  30.84 
 
 		 468 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1629  ferredoxin  30.84 
 
 		 468 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0618  NADH dehydrogenase subunit G  36.28 
 
 		 683 aa  231  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3187  ferredoxin  30.84 
 
 		 468 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2827  NADH dehydrogenase subunit G  40.92 
 
 		 686 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.655346  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39049  predicted protein  38.82 
 
 		 685 aa  229  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0489184  normal  0.0880451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2000  NADH dehydrogenase subunit G  38.01 
 
 		 671 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4627  NADH dehydrogenase subunit G  36.93 
 
 		 692 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  34.87 
 
 		 783 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  34.87 
 
 		 783 aa  227  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0275  NADH dehydrogenase subunit G  40.13 
 
 		 744 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0246  NADH dehydrogenase subunit G  40.13 
 
 		 744 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.527407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2924  NADH dehydrogenase subunit G  36.57 
 
 		 687 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>