34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5042 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  230  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  80.56 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  60.53 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  52.78 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  57.89 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  33.64 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  47.62 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  54.05 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  54.05 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  53.33 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  51.35 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  45.95 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  60.71 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  60.71 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  64 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  53.12 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  43.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  43.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  43.18 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  48.65 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  30.95 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5257  hypothetical protein  54.84 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  53.12 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  56.25 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  47.37 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  55.88 
 
 		 102 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>