22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6776 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  167  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  87.95 
 
 
84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  58.49 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
182 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  53.97 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  50.79 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  41.98 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  43.1 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  43.1 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  44.12 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  56.1 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  59.46 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  54.05 
 
 
106 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  54.05 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  31.52 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  55.88 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  52.94 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  38.57 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>