18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3862 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  91.67 
 
 		 84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  48.28 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  48.28 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  50.94 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  43.1 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  58.82 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  37.88 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  47.37 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  44.74 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  47.37 
 
 		 115 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  56.25 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  44.74 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  56.25 
 
 		 133 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>