34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2672 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  186  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  49.09 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  50.94 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  50.94 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  54.76 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  55.26 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  38.82 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  55 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  47.62 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  52.5 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  47.5 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  41.51 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  48.08 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  51.22 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  39.39 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  51.22 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0444  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.806822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  38.64 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  41.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  51.22 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  51.22 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  56.67 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1354  hypothetical protein  32.05 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8726  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  51.22 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  37.74 
 
 		 111 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>