16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2353 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5561  hypothetical protein  52.83 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  44.44 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  37.89 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  40.51 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  40.51 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  48.08 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  52.78 
 
 
94 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  51.35 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  52.78 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  37.5 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  52.78 
 
 
88 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  34.38 
 
 
102 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  56.67 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>