25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3129 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  248  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  96.77 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  68.66 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  88.1 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  88.1 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  83.33 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  85.71 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  80.56 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  80.56 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  69.44 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  56.41 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  61.29 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  35.37 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  54.84 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  58.06 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  54.84 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  51.35 
 
 		 87 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  54.84 
 
 		 108 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05420  hypothetical protein  51.61 
 
 		 58 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  47.62 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  41.89 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  47.5 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  53.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  48.72 
 
 		 92 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>