22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3653 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  89.77 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  87.5 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  81.63 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  93.02 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  71.19 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  69.49 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  80.56 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  72.22 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  54.35 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  54.55 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  38.36 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  51.22 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  36.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  44.78 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  38.67 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5561  hypothetical protein  44.74 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05420  hypothetical protein  53.33 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>