17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5871 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  87.95 
 
 
84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  54.24 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  56.06 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  60.38 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  55.56 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  48.28 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  48.28 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  38.75 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  49.09 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  44.12 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  53.66 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  56.76 
 
 
132 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  51.35 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  48.65 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1222  hypothetical protein  52.17 
 
 
58 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>