13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1222 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  55.17 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4256  hypothetical protein  60 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4157  hypothetical protein  58 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.266074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4121  hypothetical protein  46.15 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.888422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  47.62 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  47.62 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  44 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8726  hypothetical protein  42 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7973  hypothetical protein  40.38 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  52.63 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  52.17 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0037  hypothetical protein  43.9 
 
 		 119 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>