18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1301 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4256  hypothetical protein  70.69 
 
 		 58 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4157  hypothetical protein  67.24 
 
 		 58 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.266074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1222  hypothetical protein  55.17 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  57.89 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  57.89 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  46.34 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4121  hypothetical protein  47.92 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.888422  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  54.05 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  51.22 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  46.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  52.63 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  43.9 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  43.9 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  43.9 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0444  hypothetical protein  40.43 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.806822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>