14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2575 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  259  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  55.26 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  56.1 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  56.1 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  56.1 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  46.34 
 
 		 58 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  59.46 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  38.64 
 
 		 92 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  39.39 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>