19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3989 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  96.99 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  63.91 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  62.16 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  46.15 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  63.33 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  56.25 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  51.28 
 
 		 85 aa  40.8  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  56.25 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  51.52 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>