31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3145 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  88.12 
 
 
101 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  69.09 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  70.91 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  82.93 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  82.93 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  82.93 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  82.93 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  52.75 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  61.9 
 
 
73 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  46.67 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  46.15 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1354  hypothetical protein  47.06 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  46.58 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  45.21 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05420  hypothetical protein  58.06 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556903  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  56.67 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  41.79 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  69.23 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  48.57 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  35.29 
 
 
97 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5257  hypothetical protein  34.52 
 
 
84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  47.22 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  55.88 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  34.12 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  45.65 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  34.12 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  54.55 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  34.04 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  52.94 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>