18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4470 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  228  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  64.66 
 
 
133 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  77.03 
 
 
133 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  65.79 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  55 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  39.13 
 
 
106 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  33.04 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  44.9 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  43.55 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  51.28 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  51.52 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  34.52 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  40.74 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  53.33 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6364  hypothetical protein  51.35 
 
 
86 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  58.06 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  58.06 
 
 
114 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>