20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6364 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6364  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  163  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  71.7 
 
 
85 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  43.66 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  41.46 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  51.92 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  42.67 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  46.15 
 
 
102 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  41.89 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  54.55 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  43.64 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  42.37 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  53.85 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  51.52 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  55.56 
 
 
115 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  38.67 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8726  hypothetical protein  48.28 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  55.56 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  30.11 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  36.71 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4121  hypothetical protein  52.94 
 
 
56 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.888422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>