27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2545 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  208  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  87.23 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  85.11 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3653  hypothetical protein  85.71 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145972  normal  0.0951957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4054  hypothetical protein  85.71 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.105859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1789  hypothetical protein  85.71 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1820  hypothetical protein  83.33 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0429652  normal  0.370379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  51.35 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  80.56 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  72.22 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  39.02 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  35.37 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1354  hypothetical protein  44.68 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  56.67 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5908  hypothetical protein  30.95 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  60.71 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5257  hypothetical protein  31.63 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  54.84 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1516  hypothetical protein  45.71 
 
 		 140 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  46.88 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  38.57 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  34.55 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>