26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5323 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  80.56 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  57.89 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  60.53 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  52.78 
 
 
73 aa  48.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  55.26 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  55.26 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  34.09 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  54.05 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  54.05 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  53.33 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  31.82 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  52.94 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  60.71 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  51.35 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  51.35 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  55.88 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  57.14 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  57.14 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  56.25 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  60.71 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  56.25 
 
 
133 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>