19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6999 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  163  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  82.28 
 
 
79 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  81.01 
 
 
79 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  64.15 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  60.38 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  58.49 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  48.28 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  48.28 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  44 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  47.62 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  41.51 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  54.05 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  54.05 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  51.28 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  52.78 
 
 
134 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5895  hypothetical protein  47.5 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  51.35 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  51.35 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  55.88 
 
 
106 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>