15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2925 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  82.28 
 
 
79 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  81.01 
 
 
79 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  64.15 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  56.06 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  53.97 
 
 
84 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  44 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  47.62 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  39.39 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  51.35 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  51.35 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  51.28 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  42.59 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>