33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3082 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  97.39 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  35.56 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3890  hypothetical protein  54.63 
 
 
90 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.367395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  54.76 
 
 
58 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  56.1 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  41.67 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  56.41 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  55.26 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  55.26 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  55.26 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  55.26 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  48.94 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  40.58 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  46.94 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0444  hypothetical protein  56.67 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.806822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  51.52 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4190  hypothetical protein  32.93 
 
 
84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7775  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3862  hypothetical protein  47.37 
 
 
84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0244219  normal  0.167068 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4121  hypothetical protein  54.55 
 
 
56 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.888422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6364  hypothetical protein  55.56 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  33.98 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3129  hypothetical protein  54.84 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2996  hypothetical protein  54.84 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  51.35 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  52.78 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1226  hypothetical protein  47.37 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  51.61 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  51.61 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  52.94 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>