16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4358 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  97 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  66.17 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  64.86 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  60.61 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  44.44 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  63.33 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  53.33 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  53.33 
 
 		 115 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  51.28 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3145  hypothetical protein  60 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336879  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  56.25 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  46.15 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  56.25 
 
 		 114 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>