17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7129 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6364  hypothetical protein  78.38 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  44.87 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  46.48 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  53.85 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  41.03 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  46.51 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  54.55 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36620  hypothetical protein  35.64 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0814452  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  46.43 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  52.78 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  51.52 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  52.78 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  57.58 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  57.58 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  57.58 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7973  hypothetical protein  54.84 
 
 
72 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>