15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1605 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  47.54 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2575  hypothetical protein  39.66 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3989  hypothetical protein  42.19 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4358  hypothetical protein  42.19 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8726  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4121  hypothetical protein  54.55 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.888422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2353  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4470  hypothetical protein  48.65 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  52.63 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  48.72 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  48.72 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  47.5 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  32.88 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  39.68 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>