16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5420 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5420  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.495843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  55 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  55.56 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  36.92 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1301  hypothetical protein  43.75 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8726  hypothetical protein  47.37 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5042  hypothetical protein  31.19 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  43.14 
 
 		 132 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  41.03 
 
 		 73 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1605  hypothetical protein  32.88 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  48.48 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>